1 存储单元的设计
对于一个物流中心来说，物流形态和存储单元不总是单一的，而是呈现出多样性。存储单元的设计是物流巾心的基础性工作，也是最重要的工作之一。存储单元的种类和形式多种多样，在一些比较典型复杂的系统中，存储单元可能多达几十种。可以说，合理的单元设计是实现仓储系统合理化的前提。一个合理的仓储系统，应首先针对产品特点进行存储单元设计。
2 库存量指标
存储能力是物流中心的一个重要指标，库存能力的设计对于系统合理性的影响极大。虽然存储能力是一个比较刚性的指标，但在实际应用中却不好把握。设计过大的存储能力势必造成巨大浪费，而过小的库存则将影响系统能力的正常发挥。这是所有系统集成商在每个项目中都会遇到的问题。
3 货架形式与赁架设计
货架形式或存储形式的设计也是仓储合理化的重要内容。每个从事物流系统设计的人员都知道什么是货架，但不少人都只是把货架当作简单的存储设备，而忽视了货架设计的重要性。货架种类繁多，用途也不尽相同。事实上，在决定采用的货架类型、具体尺寸以及分析货架对于具体项目的适应性的过程中，物流系统是否合理已经得到体现。
从其形式和规格来说，货架产品的种类繁多，其在仓储系统中的组合应用很重要。正确合理地选择货架应用到具体的工程项目中，对于系统集成商来说也是一项富有挑战性的工作。大到货架的选型和总体规划布局，小到货位尺寸的设计，都是货架设计的难点和重点。在实际项目中，不少系统集成商往往倾向于简单的设计：单一的货架形式，单一的货位尺寸，没有与产品结合，没有与现场配合。结果导致设计的货架系统无法满足用户的实际要求，或降低了系统的能力和效率。
4 物流系统的流畅性
仓储系统设计的另一个关键要素是保障系统的流畅性，包括入库、直配、拣选、出库、补货等操作过程的流畅性和合理性，以及总体路线的优化等。
5 成本和运营
成本一直是仓储系统设计的重要指标，是必须要考虑的因素。此外，系统运营费用也是不容忽视的重要内容。
